如果支付宝逾期后有进账就被扣除，首先要先明确扣除的影响原因。一般而言，支付宝会在用户的使用逾期还款之后先扣除逾期还款的信用金额，然后扣除逾期利息和滞纳金等费用。如果用户的扣款逾期金额已经扣除完，而进账却仍然被扣除，可能是由于其他原因导致的里面。

一种可能的方法原因是支付宝系统出现了错误。在这种情况下，用户应该及时联系支付宝客服，说明自己的不要情况，并提供相关的收款交易记录和凭证，以便支付宝进行核查和处理。支付宝客服会在核对用户提供的那么信息后进行处理，并将扣除错误的不会金额返还给用户。

另一种可能的有钱原因是用户的就会支付宝账户存在其他问题。例如，可能存在其他未还款的方式账单或欠款，导致进账被自动扣除。用户需要仔细检查自己的支付宝交易记录，核对是否有其他未处理的只要账单或欠款。如果是这种情况，用户应尽快处理未还款的银行卡账单或欠款，以避免进一步产生逾期费用和扣除。

此外，用户还可以考虑采取以下措来应对支付宝逾期被扣除进账的问题：

1.提前清算逾期款：及时了解自己的逾期欠款情况，并尽量在还款日期之前进行还款，以避免产生逾期费用和滞纳金。

2.与支付宝客服沟通：在出现问题时，及时联系支付宝客服，说明自己的银行情况，并提供相关的交易记录和凭证，以便支付宝进行核查和处理。

3.避免再次逾期：在逾期款还清后，要注意合理安排财务，并确保按时还款，避免再次逾期的情况发生。

4.寻求专业帮助：如果遇到较为复杂或无法解决的时间问题，可以寻求专业的法律或财务咨询机构的帮助，以获得更详细和专业的建议。