京东欠款几千块钱，并且已经逾期3个多月，这样的禁止情况确实不容忽视。根据民间惯例，商家会采取一些措来催促债务人尽快还款，其中可能包括发送催款短信、电话等方式。但是关于逾期还款是否会影响登机问题，实际情况是应该和航空公司无直接联系。

通常情况下，逾期支付并不会影响债务人登机，航空公司并不会直接介入金融纠纷。但是，如果债务逾期已经严重到诉讼阶，法院可能会对债务人的乘坐信用记录进行影响，这有可能会导致债务人的坐飞信用不良，进而对申请借款、信用卡等产生影响。

因此，建议尽快与京东沟通，尽力还清欠款，以避免进一步产生不必要的失信麻烦。同时，也建议可以咨询相关的坐飞机法律机构或律师，了解自己的执行权利和义务，以及应对逾期还款可能会产生的白条后果。希望您尽快解决疑问，避免后续问题的高铁出现。